兵团第十二师前身是乌鲁木齐西郊农场管理处，1964年1月成立，隶属新疆维吾尔自治区农垦厅；1982年4月，接受新疆生产建设兵团和乌鲁木齐市的双重领导，更名为新疆生产建设兵团乌鲁木齐农场管理局；2000年11月，更名为新疆生产建设兵团农业建设第十二师；2001年2月，完全转入兵团体制管理序列；2012年12月，正式更名为新疆生产建设兵团第十二师。

（2023年5月18日更新）