近日，兵团公安警用本土犬种科研攻关实现突破，“基于新疆牧羊犬种质保纯与警犬选育关键技术研发应用”项目组发布核心基因组研究成果，确认新疆牧羊犬为我国北方独立原生本土犬种，终结了其为外来引进品种改良的长期学术争议。

据悉，该研究项目于2025年8月经兵团科技局批准立项，由新疆政法学院牵头，联合中国科学院昆明动物研究所、兵团警犬繁育训练中心共同实施。项目团队历时数月，足迹遍布全疆核心产区，完成109份新疆牧羊犬样本的高质量全基因组测序，累计检测出2500万个变异位点，与涵盖全球260个犬品种的权威数据库进行了海量比对。

结果显示，新疆牧羊犬种群基因图谱高度聚拢，血统纯正、遗传结构稳定，属于独立遗传家系；与欧洲各类犬种基因交集极少、遗传距离极远，与我国北方地方土犬存在紧密血脉关联。这一结论从物种演化层面，为新疆牧羊犬系“中国北方本土原生犬种”的定位提供了决定性科学依据，也为该犬种种质资源保护与纯种繁育奠定了分子遗传学基础。

目前，新疆牧羊犬已作为制式警用装备列装兵团各师市。